เบนโซ[d]ไอโซซาโซล-5-เอมีนถูกนำมาใช้ในงานวิจัยและพัฒนายา โดยเฉพาะอย่างยิ่งในกลุ่มสารออกฤทธิ์ทางจิตประสาทและยารักษาโรคทางระบบประสาท สารนี้มีศักยภาพในการเป็นสารตั้งต้นสำหรับการสังเคราะห์สารประกอบอื่น ๆ ที่มีฤทธิ์ทางเภสัชวิทยา เช่น ยาต้านอาการซึมเศร้า ยาต้านอาการวิตกกังวล และยารักษาโรคจิตเภท นอกจากนี้ ยังมีการศึกษาเบื้องต้นเกี่ยวกับการใช้สารนี้ในกระบวนการทางเคมีเพื่อพัฒนายาใหม่ที่มีประสิทธิภาพสูงและผลข้างเคียงน้อย