5-Bromobenzo[d]isothiazol-3-amine ใช้หลัก ๆ ในการสังเคราะห์อินทรีย์ สารประกอบนี้ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตยาต่าง ๆ โดยเฉพาะยาที่มุ่งเป้าไปที่โรคทางระบบประสาท โครงสร้างของมันมีคุณค่าในการพัฒนาสารประกอบที่มีศักยภาพในการต้านการอักเสบและต้านจุลินทรีย์ นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการวิจัยเพื่อสร้างสารประกอบเฮเตอร์โรไซคลิกใหม่ ๆ ซึ่งจำเป็นในกระบวนการค้นพบยาและวิทยาศาสตร์วัสดุ การประยุกต์ใช้ของมันขยายไปถึงการสังเคราะห์สีย้อมและเม็ดสี ซึ่งส่วนประกอบโบรมีนช่วยเพิ่มความเสถียรและปฏิกิริยา