2-Mercapto-5-benzimidazolecarboxylic Acid ถูกใช้หลักในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยาหลากหลายชนิด โดยเฉพาะยาที่ขัดต่อโรคทางเดินอาหาร โครงสร้างแกนเบนซิมิดาโซลของมันมีความสำคัญในการพัฒนายับยั้งโปรตอนปั๊ม ซึ่งมีประสิทธิภาพในการรักษาโรคที่เกี่ยวข้องกับกรด เช่น แผลในกระเพาะอาหารและโรคกรดไหลย้อน (GERD) นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างสำหรับสร้างโมเลกุลซับซ้อนที่มีคุณสมบัติบำบัดที่เป็นไปได้ กลุ่ม thiol ของมันยังมีประโยชน์ในการศึกษาทางชีวเคมีบางอย่าง โดยเฉพาะการปรับเปลี่ยนโปรตีนและการวิจัยการยับยั้งเอนไซม์