2-Amino-5-(trifluoromethyl)benzoimidazole ถูกใช้หลักๆ ในงานวิจัยเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลชีวภาพต่างๆ โครงสร้างของสารนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนายาที่เล็งเป้าไปยังโรคทางระบบประสาทและมะเร็งบางประเภท นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในงานวิจัยเกษตรเคมีเพื่อสร้างสารประกอบที่ช่วยเสริมการป้องกันพืช หมู่ trifluoromethyl ในโครงสร้างช่วยเพิ่มความเสถียรและ bioavailability ทำให้เป็นตัวเลือกที่นิยมในเคมียา