ใช้ในสังเคราะห์สารประกอบเบนโซอิมิดาโซลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น สารต้านจุลชีพ สารต้านเชื้อรา และสารต้านไวรัส นิยมเป็นสารตั้งต้นในการพัฒนายาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง และยาต้านมะเร็ง โดยนำไปทำปฏิกิริยาต่อเพื่อสร้างอนุพันธ์ที่มีคุณสมบัติเฉพาะทางด้านเภสัชกรรม นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านเคมีทางการแพทย์เพื่อศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างโครงสร้างกับกิจกรรมของสาร