ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยาเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนาสารต้านไวรัสและต้านมะเร็ง โครงสร้างของมันสนับสนุนกิจกรรมต่อเป้าหมายเอนไซม์บางชนิด เช่น คินาสและอินทิเกรส เนื่องจากมีหมู่ฮาโลเจนและเบนซิลที่เพิ่มความสัมพันธ์ในการจับมั่น ใช้ในงานวิจัยเพื่อออกแบบยาเบนซิมิดาโซลใหม่ที่มีความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและความเลือกสรรที่ดีขึ้น นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยเกษตรเคมีสำหรับพัฒนาฟังไจไซด์ใหม่ที่มีการออกฤทธิ์แบบระบบ