5-Bromo-2-fluoroisophthalamide ถูกนำมาใช้ในงานวิจัยทางเคมีและเภสัชวิทยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เนื่องจากโครงสร้างทางเคมีที่มีทั้งหมู่โบรโมและฟลูออโร ทำให้มีศักยภาพในการออกฤทธิ์ทางชีวภาพที่หลากหลาย มักถูกศึกษาว่ามีฤทธิ์ต้านมะเร็งหรือต้านเชื้อจุลินทรีย์ นอกจากนี้ยังใช้เป็นสารตั้งต้นหรือสารกลางในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมีอื่น ๆ ที่มีความซับซ้อนมากขึ้น โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและการผลิตยา