ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ยา sulfa และสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพอื่นๆ หมู่ chlorosulfonyl ที่ทำปฏิกิริยาได้ง่ายช่วยให้สามารถทำปฏิกิริยากับอะมีนหรือแอลกอฮอลได้ง่าย ทำให้มีคุณค่าในการพัฒนายาเภสัชกรรม ใช้บ่อยในการเตรียมตัวยับยั้งแบบ sulfonamide ที่เล็งเป้าไปยังเอนไซม์ เช่น carbonic anhydrase นอกจากนี้ยังใช้ในการผลิตสีย้อมและโพลิเมอร์ฟังก์ชันเนื่องจากความสามารถในการนำโครงสร้าง sulfonamide linkages เข้าสู่กรอบโมเลกุลขนาดใหญ่