2-Bromo-3,4-difluorobenzaldehyde นิยมใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารเคมีที่มีความซับซ้อน โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเคมีอินทรีย์ เนื่องจากโครงสร้างที่มีทั้งหมู่โบรมีนและฟลูออรีน ทำให้สามารถนำไปใช้ในการสร้างสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาต้านจุลชีพหรือสารยับยั้งเอนไซม์ นอกจากนี้ ยังอาจใช้ในการวิจัยและพัฒนายาใหม่ๆ เพื่อศึกษาประสิทธิภาพและกลไกการออกฤทธิ์ของสารเคมีในร่างกาย