WEHI-539 ใช้ในการวิจัยทางวิทยาศาสตร์เพื่อศึกษากลไกการตายของเซลล์แบบอะพอพโทซิส โดยเฉพาะการยับยั้งโปรตีน BCL-XL ซึ่งมีบทบาทสำคัญในการป้องกันการตายของเซลล์มะเร็ง การใช้สารนี้ช่วยให้นักวิจัยสามารถเข้าใจกระบวนการทางชีววิทยาที่เกี่ยวข้องกับการอยู่รอดของเซลล์มะเร็ง และอาจนำไปสู่การพัฒนายาใหม่ๆ ที่มุ่งเป้าไปที่โปรตีน BCL-XL เพื่อรักษาโรคมะเร็งได้อย่างมีประสิทธิภาพมากขึ้น นอกจากนี้ ยังมีการศึกษาเพื่อประเมินศักยภาพของ WEHI-539 ในการใช้ร่วมกับการรักษาแบบอื่นๆ เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพในการทำลายเซลล์มะเร็ง