WEHI-539 ถูกใช้ในการวิจัยทางการแพทย์เพื่อศึกษากลไกการตายของเซลล์มะเร็ง โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการยับยั้งโปรตีน BCL-XL ซึ่งเป็นโปรตีนที่ช่วยให้เซลล์มะเร็งหลีกเลี่ยงการตายตามธรรมชาติ การยับยั้ง BCL-XL ด้วย WEHI-539 สามารถทำให้เซลล์มะเร็งเข้าสู่กระบวนการ apoptosis หรือการตายของเซลล์ได้ ดังนั้นสารนี้จึงมีศักยภาพในการพัฒนายาต้านมะเร็งชนิดใหม่ นอกจากนี้ยังมีการศึกษาเพื่อประเมินประสิทธิภาพและความปลอดภัยของ WEHI-539 ในการรักษามะเร็งชนิดต่าง ๆ เช่น มะเร็งปอดและมะเร็งเม็ดเลือดขาว การวิจัยเหล่านี้ยังอยู่ในขั้นทดลองและจำเป็นต้องศึกษาต่อไปก่อนที่จะนำมาใช้ในคลินิก