Azido-PEG9-Boc ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในกระบวนการสังเคราะห์ทางเคมี โดยเฉพาะในการสร้างลิงค์เกอร์ (linker) สำหรับการเชื่อมต่อโมเลกุลต่าง ๆ ในงานวิจัยทางชีวเคมีและเภสัชวิทยา กลุ่ม Azido ในโครงสร้างช่วยให้เกิดปฏิกิริยา Click Chemistry ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่รวดเร็วและมีความจำเพาะสูง มักใช้ในการปรับเปลี่ยนพื้นผิวของวัสดุหรือโมเลกุลชีวภาพ เช่น โปรตีน เปปไทด์ หรืออนุภาคนาโน ส่วนกลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกัน (protecting group) สำหรับหมวดหมู่เอมีน ช่วยให้สามารถควบคุมการเกิดปฏิกิริยาได้อย่างแม่นยำในขั้นตอนการสังเคราะห์ นอกจากนี้ PEG9 (polyethylene glycol) ที่มีอยู่ในโครงสร้างยังช่วยเพิ่มความสามารถในการละลายและลดความเป็นพิษของสาร ทำให้เหมาะสำหรับการใช้งานในระบบชีวภาพ เช่น การพัฒนายาหรือสารส่งนำยา (drug delivery systems)