Azido-PEG3-MS ถูกใช้อย่างแพร่หลายในงาน bioconjugation และ click chemistry เนื่องจากมีกลุ่มฟังก์ชัน azide ซึ่งช่วยให้เกิดปฏิกิริยาที่มีประสิทธิภาพและเลือกสรรกับสารประกอบที่มีกลุ่ม alkyne ผ่าน copper-catalyzed azide-alkyne cycloaddition (CuAAC) มันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการปรับเปลี่ยน biomolecules เช่น โปรตีน เปปไทด์ และแอนติบอดี สำหรับวัตถุประสงค์การติดฉลาก การถ่ายภาพ หรือการนำส่งยา Spacer PEG3 ช่วยเพิ่มความละลายและลดการขัดขวางแบบ steric ทำให้ประสิทธิภาพของกระบวนการ conjugation ดีขึ้น นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนา bioconjugates สำหรับการบำบัดแบบกำหนดเป้าหมาย การวินิจฉัย และเครื่องมือวิจัยในสาขาต่างๆ เช่น molecular biology, biochemistry, และ material science