N,N'-bis-(azide-PEG3)-chlorocyclohexenyl Cy7 ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในงาน bioconjugation และการติดฉลาก โดยมีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนาสารเรืองแสง (fluorescent probes) สำหรับการถ่ายภาพและการวินิจฉัย สารนี้มักถูกใช้ในงานวิจัยทางชีววิทยาและเวชศาสตร์ โดยเฉพาะในการติดตามและศึกษากระบวนการทางชีวภาพในระดับเซลล์และโมเลกุล เนื่องจากส่วน Cy7 เป็นสารเรืองแสงที่อยู่ในช่วง near-infrared (NIR) ซึ่งช่วยให้สามารถถ่ายภาพในเนื้อเยื่อลึกได้ดีและเหมาะสมสำหรับการศึกษาใน vivo

กลุ่ม azide-PEG3 ในโครงสร้างช่วยอำนวยความสะดวกในการเกิดปฏิกิริยา click chemistry ทำให้สามารถเชื่อมต่อกับโมเลกุลเป้าหมายหรือพื้นผิวได้อย่างมีประสิทธิภาพและเฉพาะเจาะจง สารนี้ถูกนำมาใช้บ่อยในการศึกษากระบวนการเซลล์ ระบบส่งยา (drug delivery systems) และการติดตามโมเลกุล (molecular tracking) โดยให้ความไวและความเฉพาะเจาะจงสูงในการวิจัยทางชีววิทยา

นอกจากนี้ กลุ่ม azide และ PEG3 ในโครงสร้างยังทำให้สารนี้สามารถเชื่อมต่อกับโมเลกุลอื่นๆ ได้ง่ายผ่านปฏิกิริยา click chemistry ซึ่งเป็นประโยชน์ในการสร้างสารประกอบใหม่สำหรับการวิจัยหรือการวินิจฉัยทางการแพทย์ เช่น การติดฉลากเซลล์หรือโปรตีนเพื่อการศึกษาด้วยเทคนิค fluorescence imaging นอกจากนี้ ส่วน chlorocyclohexenyl ยังช่วยเพิ่มความเสถียรและ reactivity ทำให้เป็นเครื่องมือที่หลากหลายใน chemical biology และ material science