ใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง โครงสร้างของสารนี้สนับสนุนการสร้างโมเลกุลชีวภาพที่มีกิจกรรมเนื่องจากการมีทั้งกลุ่มฟังก์ชันอะมีนและเอสเตอร์ ทำให้สามารถทำการปรับเปลี่ยนทางเคมีที่หลากหลายได้ ใช้อย่างแพร่หลายในเคมีทางการแพทย์สำหรับการสร้างเพปไทโดมิมิติกส์และตัวยับยั้งไคเนส ยังถูกใช้ในการเตรียมตัวปรับตัวรับแบบเลือกสรร รวมถึงตัวที่เล็งเป้าไปที่ความผิดปกติทางระบบประสาท กลุ่มเบนซิลคาร์บาเมตทำหน้าที่เป็นกลุ่มคุ้มครองในระหว่างการสังเคราะห์เปปไทด์ ซึ่งช่วยให้สามารถถอดกลุ่มคุ้มครองและขั้นตอนการเชื่อมต่อได้อย่างควบคุมในปฏิกิริยาขั้นตอนหลายขั้น