ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนาโมเลกุลชีวภาพที่มีฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง หมู่อะมีนที่ได้รับการป้องกันและหมู่ฟังก์ชันคาร์บอกซิลิกแอซิดช่วยให้เกิดปฏิกิริยาเลือกเฉพาะในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์หลายขั้นตอน ใช้อย่างแพร่หลายในเคมีทางการแพทย์สำหรับการสร้างเพปไทโดมิมเมติกส์และโครงสร้างเฮเทอโรไซคลิก เนื่องจากโครงสร้างวงแหวนเจ็ดสมาชิกที่ให้ความยืดหยุ่นทางคอนฟอร์เมชัน หมู่อะซีพาเนที่ป้องกันด้วย Boc มีคุณค่าในการปรับปรุงคุณสมบัติที่คล้ายยา เช่น ละลายน้ำ ความเสถียรทางเมแทบอลิซึม และความสัมพันธ์ในการจับกับตัวรับ