3-BOC--3-Azaspiro[5.5]undecane-9-carboxylic acid ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่มีโครงสร้างซับซ้อน โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตยาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ มักใช้ในการสร้างโมเลกุลเป้าหมายที่มีโครงสร้างสไปโร (spiro) ซึ่งพบในยาหลายชนิด เช่น ยาต้านไวรัส ยาต้านมะเร็ง และยาที่มีผลต่อระบบประสาท นอกจากนี้ ยังสามารถนำไปใช้ในการพัฒนาสารเคมีสำหรับการวิจัยทางเภสัชวิทยา เพื่อศึกษากลไกการออกฤทธิ์และประสิทธิภาพของสารใหม่ ๆ