2-Azaspiro[3.5]nonane ถูกใช้หลักly เป็นสารประกอบพื้นฐานในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในด้านการพัฒนายาในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม โครงสร้างสไปโรไซคลิกที่ไม่เหมือนใครทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะเจาะจง มักถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์ยารักษาโรคทางระบบประสาท เช่น ยากล่อมประสาทและยารักษาโรคจิต เนื่องจากความสามารถในการโต้ตอบกับระบบสารสื่อประสาท นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตสารประกอบที่มีศักยภาพในการต้านการอักเสบและยาแก้ปวด คุณสมบัติที่หลากหลายในเคมียารักษาโรคยังขยายไปถึงการพัฒนาลิแกนด์สำหรับการศึกษาการจับตัวรับ ซึ่งช่วยในการค้นพบตัวแทนบำบัดใหม่