N-Tosyl-4-chloro-3-iodo-7-azaindole ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในการสังเคราะห์สารเคมีและยา โดยเฉพาะในกระบวนการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนเพื่อการวิจัยทางเภสัชวิทยา สารนี้มักใช้เป็นสารตั้งต้นหรือ intermediate ในการสังเคราะห์สารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาต้านมะเร็งหรือยาต้านไวรัส เนื่องจากโครงสร้างที่มีทั้งหมู่ไอโอดีนและคลอรีนช่วยให้สามารถทำปฏิกิริยาเคมีได้หลากหลาย นอกจากนี้ยังมีการนำไปใช้ในการพัฒนาสารเคมีเพื่อการศึกษาทางเคมีอินทรีย์และเคมีเภสัชกรรม โดยเฉพาะการสร้างสารประกอบเฮเทอโรไซคลิกที่มีศักยภาพในการรักษาโรค