2-Fluoro-4-nitrophenylacetonitrile ถูกใช้หลักๆ ในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะสารกลางที่หลากหลายสำหรับการพัฒนาสารประกอบเคมีที่ซับซ้อนมากขึ้น โครงสร้างของมันซึ่งมีทั้งกลุ่มไนไทรล์และกลุ่มไนโตร ทำให้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีทางการเกษตร สารนี้มักถูกนำมาใช้ในการเตรียมส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) โดยที่กลุ่มไนไทรล์สามารถถูกแปลงต่อไปเป็นกลุ่มฟังก์ชันต่างๆ เช่น อะมีน กรดคาร์บอกซิลิก หรืออะไมด์ นอกจากนี้ การมีกลุ่มไนโตรยังช่วยให้สามารถดัดแปลงเคมีเพิ่มเติมได้ รวมถึงการรีดักชันเป็นอะมีนหรือการเข้าร่วมในปฏิกิริยาการแทนที่นิวคลีโอฟิลิกอะโรมาติก สารเคมีนี้ยังถูกใช้ในสถานที่วิจัยสำหรับการพัฒนาโมเลกุลอินทรีย์ใหม่ที่มีกิจกรรมทางชีวภาพที่เป็นไปได้ ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างหลักในเคมียารักษาและกระบวนการค้นพบยา