สารประกอบนี้ถูกนำมาใช้หลักในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตร เนื่องจากโครงสร้างทางเคมีที่หลากหลายของมัน มันทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการผลิตสารออกฤทธิ์ต่างๆ โดยเฉพาะในการพัฒนาสารประกอบฟลูออรีน อะตอมฟลูออรีนช่วยเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพและความเสถียรของผลิตภัณฑ์สุดท้าย ทำให้มีคุณค่าต่อการค้นพบยาและการป้องกันพืช นอกจากนี้ยังถูกใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เพื่อสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในการก่อตัวของสารประกอบเฮเตอร์โรไซคลิก ซึ่งมีความสำคัญในเคมียารักษาโรค