3-Bromo-2-fluorophenylacetonitrile ใช้หลักในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ในฐานะสารกลางที่หลากหลาย มักนำไปใช้ในการพัฒนายา โดยทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการสังเคราะห์โมเลกุลที่ซับซ้อน หมู่โบรโมและฟลูออโรของสารนี้ทำให้เหมาะสมเป็นพิเศษสำหรับปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม เช่น ปฏิกิริยา Suzuki หรือ Buchwald-Hartwig ซึ่งจำเป็นสำหรับการสร้างสารที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ นอกจากนี้ ยังนำไปประยุกต์ใช้ในงานวิจัยเคมีเกษตรเพื่อการออกแบบและผลิตยาฆ่าแมลงหรือสารกำจัดวัชพืชใหม่ๆ หมู่ไซยาไนด์ยังช่วยให้สามารถปรับแต่งโครงสร้างเพิ่มเติม สร้างโครงสร้างเคมีที่หลากหลายสำหรับวัตถุประสงค์ทางอุตสาหกรรมและการวิจัยต่างๆ