3-Methylisoxazol-5-yl trifluoromethanesulfonate เป็นสารเคมีที่ใช้อย่างแพร่หลายในกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในการสร้างโมเลกุลซับซ้อนที่มีโครงสร้าง isoxazole สารนี้ทำหน้าที่เป็น electrophile ในปฏิกิริยา cross-coupling เช่น Suzuki และ Heck reactions โดยกลุ่ม trifluoromethanesulfonate ทำหน้าที่เป็น leaving group ที่มีประสิทธิภาพสูง ช่วยในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนและคาร์บอน-เฮเทอโรอะตอม คุณสมบัตินี้มีความสำคัญในการสังเคราะห์สารกลางสำหรับเภสัชภัณฑ์ สารเคมีเกษตร และวัสดุขั้นสูง นอกจากนี้ ความเสถียรและปฏิกิริยาของสารยังเหมาะสำหรับการพัฒนาสารประกอบทางชีวภาพและการสังเคราะห์ heterocycles ซึ่งจำเป็นต่อการค้นคว้าและพัฒนายา