2-Fluoro-4-iodopyridine ถูกนำมาใช้ในงานวิจัยทางเคมีอินทรีย์ โดยเฉพาะในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีความซับซ้อน เนื่องจากมีกลุ่มฟลูออรีนและไอโอดีนที่สามารถทำปฏิกิริยาได้ดี มักใช้เป็นสารตั้งต้นในการสร้างโมเลกุลเป้าหมายผ่านปฏิกิริยาคัปปลิง (coupling reactions) เช่น ปฏิกิริยา Suzuki-Miyaura หรือปฏิกิริยา Sonogashira นอกจากนี้ ยังมีบทบาทในการพัฒนายาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยใช้เป็นโครงสร้างหลักในการปรับปรุงคุณสมบัติทางเภสัชวิทยา และยังถูกนำไปใช้ในการศึกษาด้านวัสดุศาสตร์เพื่อสร้างสารประกอบใหม่ที่มีคุณสมบัติเฉพาะตัว