สารประกอบนี้ถูกนำมาใช้หลักๆ ในด้านการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับการพัฒนาโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น โครงสร้างของมันที่มีสารย่อยโบรโมและคลอโร ทำให้เป็นสารกลางที่มีคุณค่าต่อปฏิกิริยาครอส-คัปปลิง เช่น ปฏิกิริยาซูซูกิหรือบูชวาลด์-ฮาร์ทวิก ซึ่งจำเป็นสำหรับการสร้างเภสัชภัณฑ์ สารเคมีเกษตร และวัสดุขั้นสูง กลุ่มไดฟลูออโรเมทอกซี่เพิ่มประโยชน์ของมันโดยให้คุณสมบัติอิเล็กทรอนิกส์ที่เป็นเอกลักษณ์ ซึ่งมักปรับปรุงการดูดซึมทางชีวภาพหรือความเสถียรของสารประกอบสุดท้าย นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการสังเคราะห์ผลึกเหลวและวัสดุฟังก์ชันอื่นๆ เนื่องจากความสามารถในการอิทธิพลการจัดเรียงโมเลกุลและพฤติกรรมเฟส การประยุกต์ใช้ของมันมีความสำคัญอย่างยิ่งในเคมียารักษา ซึ่งมีส่วนช่วยในการสร้างผู้สมัครยาที่กำหนดเป้าหมายไปยังโรคต่างๆ