ใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในปฏิกิริยาที่ต้องการวงแหวนอะโรมาติกที่มีโบรมีนสำหรับกระบวนการจับคู่ เช่น ปฏิกิริยาซูซูกิหรือเฮ็ค หมู่ดิฟลูออโรเอทอกซิช่วยเพิ่มความชอบไขมันและความเสถียรทางเมแทบอลิซึม ทำให้สารนี้มีคุณค่าในการพัฒนาโมเลกุลชีวภาพที่มีฤทธิ์ นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมของเหลวผลึกและวัสดุฟังก์ชันนัลเนื่องจากคุณสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์และโครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์