1-คลอโร-4-ไอโอโดนาฟทาลีนใช้หลักในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ในฐานะสารกลางอเนกประสงค์สำหรับการเตรียมสารประกอบเคมีที่ซับซ้อนยิ่งขึ้น โครงสร้างของมันซึ่งมีทั้งสารย่อยคลอรีนและไอโอดีน ช่วยให้สามารถปรับแต่งหน้าที่เฉพาะเจาะจงผ่านปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม เช่น ปฏิกิริยา Suzuki หรือ Sonogashira ซึ่งจำเป็นสำหรับการพัฒนายาเคมีเกษตร และวัสดุขั้นสูง นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นหน่วยก่อสร้างในการสังเคราะห์สารกึ่งตัวนำอินทรีย์และของเหลวผลึก ซึ่งเป็นส่วนประกอบสำคัญในอุปกรณ์อิเล็กทรอนิกส์และเทคโนโลยีการแสดงผล ความตอบสนองของสารประกอบนี้ยังมีคุณค่าต่อการวิจัยในการศึกษากลไกการเกิดปฏิกิริยาและการพัฒนาวิธีการสังเคราะห์ใหม่ๆ