3-Bromo-2-fluorotoluene ถูกใช้หลักly เป็นสารกลางในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการผลิตเภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตร โครงสร้างที่ไม่เหมือนใครซึ่งมีทั้งกลุ่มโบรมีนและฟลูออรีน ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่มีคุณค่าตในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น สารประกอบนี้มักถูกนำมาใช้ในปฏิกิริยาครอส-คัปปลิ้ง เช่น Suzuki หรือ Buchwald-Hartwig couplings เพื่อนำวงแหวนอะโรมาติกที่มีฟังก์ชันฮาโลเจนเฉพาะเข้าไปในสารประกอบเป้าหมาย ซึ่งมีความสำคัญอย่างยิ่งในการค้นพบและพัฒนายา ที่ซึ่งการปรับเปลี่ยนโมเลกุลอย่างแม่นยำจำเป็นต้องใช้เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพทางชีวภาพ นอกจากนี้ ยังถูกนำไปใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีพิเศษ รวมถึงสีย้อมและวัสดุอิเล็กทรอนิกส์ โดยระบบอะโรมาติกที่ถูกฮาโลเจนของมันสามารถมีส่วนช่วยในคุณสมบัติที่ต้องการ เช่น ความเสถียรหรือปฏิกิริยา บทบาทของมันในแอปพลิเคชันเหล่านี้แสดงให้เห็นถึงความสำคัญในการพัฒนาเคมีอุตสาหกรรมและการแพทย์