2-Methoxythiazole-5-boronic acid ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในด้านการสังเคราะห์สารเคมี โดยเฉพาะในปฏิกิริยา cross-coupling reactions เช่น Suzuki-Miyaura coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่สำคัญในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบอินทรีย์ที่มีหมู่โบรอนกับสารประกอบที่มีหมู่ฮาโลเจนหรือทริฟเลต การใช้งานนี้ช่วยในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนซึ่งมีประโยชน์ในอุตสาหกรรมยาและวัสดุศาสตร์ นอกจากนี้ยังสามารถใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารเคมีอื่นๆ ที่มีโครงสร้าง thiazole ซึ่งเป็นโครงสร้างที่พบได้บ่อยในสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพและยาต่างๆ