(5,6-Dimethylpyridin-3-yl)boronic acid ใช้เป็นสารตั้งต้นในปฏิกิริยาเคมีต่างๆ โดยเฉพาะในปฏิกิริยาคุปปลิง (Suzuki coupling) ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่ใช้ในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบโบรอนและสารประกอบอะริลหรือวินิลฮาไลด์ สารนี้มักถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ที่มีโครงสร้างซับซ้อน เช่น ยา สารเคมีทางการเกษตร และวัสดุอิเล็กทรอนิกส์ นอกจากนี้ ยังอาจถูกใช้ในการวิจัยและพัฒนายาเพื่อสร้างโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพเฉพาะเจาะจง