6-Benzyloxypyridine-3-boronic acid ใช้เป็นสารตั้งต้นในปฏิกิริยาเคมีต่างๆ โดยเฉพาะในปฏิกิริยาคุปปลิง (Suzuki coupling) ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่ใช้ในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบโบรอนิกแอซิดกับสารประกอบอาริลหรือวินิลฮาไลด์ สารนี้มีความสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ที่ซับซ้อน เช่น ยา สารเคมีทางการเกษตร และวัสดุอิเล็กทรอนิกส์ นอกจากนี้ ยังสามารถใช้ในการศึกษาปฏิกิริยาเคมีและพัฒนาวิธีการสังเคราะห์ใหม่ๆ ในด้านเคมีอินทรีย์และเคมีเภสัชกรรม