ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้งโปรติเอสและยับยั้งคินาส กลุ่มฟังก์ชันบอโรนิกแอซิดช่วยให้สามารถเข้าร่วมในปฏิกิริยาครอส-คัปเปลิงซูซูกิ-มิยาอูระ ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อนสำหรับการค้นพบยา ใช้กันทั่วไปในการเตรียมโมเลกุลชีวภาพที่ขัดต่อโรคเช่นเบาหวาน มะเร็ง และภาวะอักเสบ นอกจากนี้ยังใช้ในการออกแบบยับยั้งโคเวเลนต์เนื่องจากปฏิกิริยาของส่วนบอโรนิกแอซิดกับสารตกค้างเซรีนในตำแหน่งออกฤทธิ์ของเอนไซม์