ใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้งโปรติเอส (protease inhibitors) หมู่ฟังก์ชันกรดโบรอนิกของมันช่วยให้เกิดปฏิกิริยาการจับคู่ข้ามซูซูกิ-มิยาอูระ (Suzuki-Miyaura cross-coupling reactions) ทำให้มีคุณค่าต่อเคมียารักษาโรคสำหรับการสร้างโครงสร้างไบอาริล (biaryl structures) ใช้กันทั่วไปในการเตรียมยาที่มีโบรอน รวมถึงยาต้านมะเร็งและยาต้านไวรัสบางชนิด นอกจากนี้ยังใช้ในการออกแบบยับยั้งเอนไซม์เนื่องจากความสามารถของโบรอนในการโต้ตอบกับสารตกค้างในจุดใช้งานของโปรตีนเป้าหมาย