1-Boc-5-fluoroindole-2-boronic acid เป็นสารเคมีที่ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการเตรียมโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น โดยเฉพาะในงานวิจัยเภสัชภัณฑ์ สารนี้มักถูกนำมาใช้ในปฏิกิริยา Suzuki-Miyaura cross-coupling ซึ่งเป็นวิธีการที่ใช้กันอย่างกว้างขวางในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน ซึ่งมีความสำคัญต่อการพัฒนายา กลุ่มปกป้อง Boc (tert-butoxycarbonyl) ช่วยให้ความเสถียรระหว่างปฏิกิริยา ในขณะที่ส่วนของ boronic acid สนับสนุนการจับคู่กับอาไรล์หรือวินิลฮาไลด์ต่าง ๆ ทำให้มีคุณค่าต่อการสร้างสารประกอบที่มีโครงสร้าง indole ซึ่งพบได้บ่อยในโมเลกุลชีวภาพที่มีฤทธิ์และยาที่เล็งเป้าไปยังโรคทางระบบประสาท มะเร็ง และโรคอื่น ๆ นอกจากนี้ ผู้แทนฟลูออรีนยังสามารถเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและความสัมพันธ์ในการจับของสารประกอบที่ได้