N-Phenyl 4-borono-2-fluorobenzamide ใช้หลัก ๆ ในสาขาเคมีทางการแพทย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลที่ biologically active ต่าง ๆ กลุ่ม boronic acid ทำให้มีคุณค่าในการทำปฏิกิริยา cross-coupling แบบ Suzuki-Miyaura ซึ่งใช้กันอย่างแพร่หลายในการสร้างสารประกอบอินทรีย์ซับซ้อน รวมถึงยาเภสัชกรรม อะตอมฟลูออรีนช่วยเพิ่มศักยภาพในการพัฒนายาโดยปรับปรุงความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและความสัมพันธ์ในการจับ (binding affinity) มีความเกี่ยวข้องโดยเฉพาะในการออกแบบสารยับยั้งโปรติเอส (protease inhibitors) และตัวแทนบำบัดอื่น ๆ ที่กำหนดเป้าหมายเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะ นอกจากนี้ คุณสมบัติโครงสร้างยังทำให้เหมาะสำหรับการวิจัยในด้านการรักษามะเร็งและโรคอักเสบ