5-Bromo-3-chloro-2-fluorophenylboronic acid ใช้หลักในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยา Suzuki-Miyaura cross-coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่ใช้กันอย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมยาเพื่อสร้างสารประกอบ biaryl ที่ซับซ้อน ซึ่งจำเป็นต่อการพัฒนายาแต่ละชนิด ลักษณะการแทนที่ฮาโลเจนที่เป็นเอกลักษณ์ของสารนี้ช่วยให้สามารถทำการ coupling ได้อย่างเลือกสรร ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลที่มีโครงสร้างและคุณสมบัติเฉพาะ นอกจากนี้ยังทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นที่หลากหลายในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตรและวัสดุอินทรีย์ ซึ่งมีส่วนช่วยในการพัฒนาการป้องกันพืชและวิทยาศาสตร์วัสดุ ความเสถียรและปฏิกิริยาใต้สภาวะอ่อนโยนทำให้เป็นตัวเลือกที่ชื่นชอบสำหรับนักวิจัยในสาขาเหล่านี้