4-Aminomethylphenylboronic acid hydrochloride ใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีและเป็นสารตั้งต้นในกระบวนการผลิตยาต่างๆ โดยเฉพาะในกลุ่มของสารประกอบที่มีโครงสร้างบอโรนิกเอซิด ซึ่งมีบทบาทสำคัญในการพัฒนายารักษาโรคมะเร็งและโรคอื่นๆ นอกจากนี้ ยังถูกนำไปใช้ในงานวิจัยทางเคมีเพื่อศึกษาปฏิกิริยาและกลไกการทำงานของสารต่างๆ ในระดับโมเลกุล อีกทั้งยังมีศักยภาพในการประยุกต์ใช้ในเทคโนโลยีการตรวจวินิจฉัยโรคและการพัฒนาชุดทดสอบทางชีวภาพ