(3,5-ไดฟลูออโร-4-เมทอกซิฟีนิล)โบรอนิกแอซิด ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยาครอสคัปเปลิง Suzuki-Miyaura ปฏิกิริยานี้ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและวิทยาศาสตร์วัสดุเพื่อสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน ซึ่งช่วยให้สามารถสร้างโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อนได้ กลุ่มโบรอนิกแอซิดของมันทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญ อำนวยการครอสคัปเปลิงกับอะริลหรือไวนิลฮาไลด์ในมีอยู่ของตัวเร่งปฏิกิริยาพัลลาเดียม สารประกอบนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์โมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ เช่น ผู้สมัครยา เนื่องจากความสามารถในการนำกลุ่มฟังก์ชันเฉพาะเข้าไปในโครงสร้างเป้าหมาย นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนาวัสดุขั้นสูง รวมถึงโพลิเมอร์และส่วนประกอบอิเล็กทรอนิกส์ ซึ่งต้องการสถาปัตยกรรมโมเลกุลที่แม่นยำ