2-Bromo-3-butoxy-6-fluorophenylboronic acid ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยา Suzuki coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่ใช้ในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบ aryl halide กับ arylboronic acid สารนี้มีประโยชน์ในการผลิตสารเคมีที่มีโครงสร้างซับซ้อน เช่น ยา สารกำจัดศัตรูพืช และวัสดุอิเล็กทรอนิกส์ นอกจากนี้ยังสามารถนำไปใช้ในการวิจัยและพัฒนาสารเคมีใหม่ ๆ ในห้องปฏิบัติการ โดยเฉพาะในด้านเคมีเภสัชกรรมและเคมีวัสดุ