2-Chloro-6-fluoro-5-methylphenylboronic acid เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนผ่านปฏิกิริยาครอสคัปพลิง Suzuki-Miyaura กลุ่มบอโรนิกแอซิดของสารนี้ช่วยให้ทำปฏิกิริยากับ aryl halides ต่างๆ ทำให้มีคุณค่าต่อการผลิตเภสัชภัณฑ์ สารเคมีเกษตร และวัสดุขั้นสูง ในการค้นพบยา สารนี้ทำหน้าที่เป็นหน่วยย่อยพื้นฐานสำหรับสร้างโมเลกุลซับซ้อนที่มีคุณสมบัติบำบัดที่เป็นไปได้ นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนาวัสดุเหลวผลึกและสารประกอบอิเล็กทรอนิกส์อินทรีย์ ซึ่งช่วยส่งเสริมความก้าวหน้าในเทคโนโลยีการแสดงผลและอุปกรณ์อิเล็กทรอนิกส์ ลวดลายการแทนที่เฉพาะของสารนี้ช่วยเพิ่มความเลือกเฉพาะและปฏิกิริยาในกระบวนการสังเคราะห์ที่กำหนดเป้าหมาย