ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตยาต้านการอักเสบที่ไม่ใช่สเตียรอยด์ (NSAIDs) และโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ โครงสร้างของสารช่วยให้สามารถปรับแต่งได้ง่าย ทำให้มีคุณค่าในการสร้างสารประกอบอินทรีย์ที่ซับซ้อน ใช้บ่อยในปฏิกิริยาการควบแน่นเพื่อสร้างสารประกอบเฮเทโรไซคลิก ซึ่งพบมากในเคมียารักษาโรค นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนาสารเคมีเกษตรเนื่องจากความตอบสนองสูงและความสามารถในการนำกลุ่มฟลูออรีนเข้าไปในโมเลกุลเป้าหมาย ซึ่งช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและลิโพฟิลิก โดยเฉพาะในงานผลิตยาและสารชีวภาพที่ต้องการหมู่ไซยาโนและไตรฟลูออร์เมทิลเป็นส่วนประกอบสำคัญ สารนี้มีบทบาทในการสร้างสารกลางสำหรับการพัฒนายาที่มีฤทธิ์ต้านการอักเสบ หรือสารที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาท ความเสถียรของหมู่ไตรฟลูออร์เมทิลช่วยเพิ่มประสิทธิภาพการดูดซึมและการคงตัวของสารออกฤทธิ์ในร่างกาย จึงเป็นที่นิยมในงานวิจัยด้านเภสัชกรรม