2,6-Dichlorobenzyl Methyl Ether ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารเคมีอื่น ๆ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมยาและสารกำจัดศัตรูพืช เนื่องจากโครงสร้างที่มีคลอรีนและกลุ่มอีเทอร์ทำให้เหมาะสำหรับการปรับเปลี่ยนโครงสร้างเพื่อสร้างสารที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในกระบวนการวิจัยและพัฒนาเพื่อศึกษาปฏิกิริยาเคมีต่าง ๆ และการออกแบบโมเลกุลใหม่ ๆ ที่มีศักยภาพในการใช้งานทางเภสัชกรรมหรือการเกษตร