ใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางสำหรับเภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตร หมู่ย่อยไอโอดีนและฟลูออรีนทำให้เหมาะสำหรับปฏิกิริยาครอส-คัปเปลิง เช่น ปฏิกิริยา Suzuki หรือ Ullmann ซึ่งช่วยในการสร้างระบบอะโรมาติกที่ซับซ้อน นิยมใช้ในการพัฒนาโมเลกุลชีวภาพที่ใช้งานได้ โดยที่อะโรมาติกที่ถูกฮาโลเจนเสริมสร้างความสามารถในการจับเฉพาะและความเสถียรทางเมแทบอลิซึม ยังนำไปใช้ในการศึกษาการติดฉลากรังสีเนื่องจากมีไอโอดีน ซึ่งช่วยในการติดตามในระบบชีวภาพ