ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้ง kinase และสารประกอบชีวภาพอื่นๆ โครงสร้างฟลูออรีนของมันช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและความสัมพันธ์ในการจับกับโมเลกุลยา ใช้อย่างแพร่หลายในเคมียารักษาเพื่อสร้างบล็อกก่อสร้างฟลูออรีนที่ปรับปรุงคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยสารเคมีเกษตรเพื่อออกแบบส่วนผสมออกฤทธิ์ใหม่ที่มีประสิทธิภาพสูงขึ้นและความเสถียรต่อสิ่งแวดล้อม