3-Amino-4-iodobenzotrifluoride ใช้เป็นสารตั้งต้นในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมีที่มีความซับซ้อน โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมยาและสารเคมีทางการเกษตร เนื่องจากโครงสร้างของมันมีทั้งกลุ่มอะมิโน กลุ่มไอโอดีน และกลุ่มไตรฟลูออโรเมทิลที่สามารถทำปฏิกิริยาได้หลากหลาย ทำให้เหมาะสำหรับการสร้างโมเลกุลใหม่ที่มีคุณสมบัติเฉพาะ นอกจากนี้ยังถูกนำไปใช้ในการวิจัยทางเคมีเพื่อพัฒนาสารประกอบที่มีศักยภาพในการรักษาโรค หรือเป็นสารช่วยในการผลิตวัสดุที่มีคุณสมบัติพิเศษ เช่น โพลิเมอร์หรือสารเคลือบผิว