ใช้เป็นสารตั้งต้นหลักในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรมแบบฟลูออรีน (APIs) ซึ่งอะตอมฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมในร่างกาย ฟังก์ชันอัลดีไฮด์ของมันช่วยให้เกิดการแปลงทางเคมีที่หลากหลาย เช่น ปฏิกิริยาการคอนเดนเซชันและการรีดักชัน ทำให้มีคุณค่าตในการสร้างโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน ใช้บ่อยในการเตรียมตัวยับยั้งไคเนสและยาสำหรับระบบประสาทส่วนกลาง เนื่องจากความสามารถในการปรับปรุงความสัมพันธ์การจับและความจำเพาะ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านเกษตรเคมีสำหรับการออกแบบยาฆ่าแมลงใหม่ที่มีความคงตัวทางสิ่งแวดล้อมที่ดีขึ้นและความจำเพาะต่อเป้าหมาย