ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม (APIs) ซึ่งสารประกอบอะโรมาติกฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพ หมู่ฟังก์ชันอัลดีไฮด์และฮาโลเจนช่วยให้เกิดการแปลงเลือกเฉพาะ ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลซับซ้อนสำหรับการค้นพบยา ใช้บ่อยในปฏิกิริยาครอส-คัปเปลิง เช่น ปฏิกิริยา Suzuki หรือ Heck เพื่อสร้างระบบไบอาริลที่พบในตัวยารักษาโรคต่างๆ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านเกษตรเคมีสำหรับออกแบบยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชใหม่ เนื่องจากคุณสมบัติการดึงอิเล็กตรอนของอะตอมฟลูออรีนที่ช่วยเพิ่มประสิทธิภาพของสารประกอบและความเสถียรต่อสิ่งแวดล้อม