3,5-Dimethoxybenzyl alcohol ใช้หลัก ๆ เป็นสารกลางในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ต่าง ๆ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเกษตรเคมี มันทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบหลักในการผลิตโมเลกุลที่ซับซ้อน รวมถึงยาบางชนิดและสารออกฤทธิ์สำหรับการป้องกันพืช โครงสร้างที่มีกลุ่มเมทอกซี่ทำให้มีคุณค่าต่อการพัฒนาสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะ นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในงานวิจัยและพัฒนาสำหรับการสร้างวัสดุใหม่และเคมีภัณฑ์ละเอียด การประยุกต์ใช้ยังขยายไปสู่สาขาการสังเคราะห์อินทรีย์ ซึ่งถูกใช้ในปฏิกิริยาเพื่อนำเข้าชนิดกลุ่มฟังก์ชันเฉพาะหรือปรับเปลี่ยนโครงสร้างโมเลกุล