ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตรที่ฟลูออรีนแทนที่ เนื่องจากมีรูปแบบการแทนที่ฮาโลเจนและตรีฟลูออร์เมทอกซีที่เป็นเอกลักษณ์ การมีโบรมีนช่วยให้สามารถปรับแต่งเพิ่มเติมผ่านปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม เช่น ปฏิกิริยา Suzuki หรือ Heck ซึ่งช่วยในการสร้างโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน หมู่ดีฟลูออโรอัลกอฮอล์ช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและลิโพฟิลิก ทำให้มีคุณค่าในการออกแบบยาเพื่อปรับปรุงชีวเภสัชจลนศาสตร์และการซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ ใช้กันทั่วไปในการพัฒนาสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในงานวิจัยเคมียารักษาโรคที่มุ่งเป้าไปยังโรคระบบประสาทส่วนกลางและโรคอักเสบ นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมยาฆ่าแมลงชนิดใหม่ที่ซึ่งอะตอมฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรต่อสิ่งแวดล้อมและประสิทธิภาพ