วิดาราบีนใช้เป็นยาต้านไวรัสเป็นหลัก โดยเฉพาะในการรักษาการติดเชื้อจากไวรัสเฮอร์ปีส์ซิมเพล็กซ์และไวรัสวาริเซลลา-ซอสเตอร์ มีประสิทธิภาพในการจัดการภาวะต่าง ๆ เช่น ไข้สมองอักเสบจากไวรัสเฮอร์ปีส์ซิมเพล็กซ์ ซึ่งเป็นการติดเชื้อรุนแรงของสมอง และโรคงูสวัดในผู้ป่วยที่มีภูมิคุ้มกันบกพร่อง สารนี้ทำงานโดยยับยั้งการสังเคราะห์ DNA ของไวรัส ทำให้ลดการแพร่พันธุ์ของไวรัส ในด้านจักษุวิทยา วิดาราบีนใช้เป็นยาทาหลอดเลือดในดวงตาเพื่อรักษาโรคกระจกตาอักเสบจากไวรัสเฮอร์ปีส์ซิมเพล็กซ์ ซึ่งเป็นการติดเชื้อตาที่อาจนำไปสู่การตาบอดหากไม่ได้รับการรักษา การใช้ยานี้ลดลงเนื่องจากการเกิดขึ้นของยาต้านไวรัสที่มีประสิทธิภาพมากกว่า แต่ยังคงเป็นตัวเลือกที่มีคุณค่าในสถานการณ์ทางคลินิกเฉพาะ การใช้ยาต้องอยู่ภายใต้การดูแลของแพทย์เนื่องจากอาจมีผลข้างเคียงรุนแรง